<div id="mb_0"><div>Hello,<br><br>I was just wondering, I have assigned a gene ontology to
an unpublished sequence. To do this I downloaded it's closest relatives
from Integr8, blasted the unpublished sequence against each of them and
made an assignment based on sequence similarity. Mainly I wanted to do
this to compare the unknown sequence to it's closest neighbours. I used
a MySQL database to complete the assignments.
<br><br>I would like to make a DAG of the gene ontology of the
unpublished sequence, however, most of the software available seems to
be for assignments made using software such as Blast2GO. My data is in
the format:<br><br>
Protein GT1           GO:0003677<br>Protein GT1           GO:0009832<br>Protein GT2           GO:0779088<br>Protein GT2           GO:0000002<br><br>Is it suitable to make a graph of this kind of data, or is there no software available,
<br><br>Thank you for your time and consideration,<br></div><div><span class="sg"><br>Roberta Scott (University of Ulster).

</span></div></div>