<meta http-equiv="CONTENT-TYPE" content="text/html; charset=utf-8"><title></title><meta name="GENERATOR" content="OpenOffice.org 3.0  (Win32)"><style type="text/css">
        <!--
                @page { margin: 2cm }
                P { margin-bottom: 0.21cm }
                A:link { so-language: zxx }
        -->
        </style>
<p style="margin-bottom: 0.5cm;"><span lang="ru-RU">Version 3</span><span lang="en-US">2</span><span lang="ru-RU">
of the Reactome Knowledgebase has been released and is accessible at
</span><font color="#000080"><span lang="zxx"><u><a href="http://www.reactome.org/" target="_blank">http://www.reactome.org</a></u></span></font><span lang="ru-RU">.
</span>
</p>
<p><span lang="ru-RU"><b>New and Updated Topics</b></span> 
</p>
<p lang="ru-RU">Version 32 includes the new topic the role of CDO in
Myogenesis. Topics revised and updated with new events and/or
revisions to existing events in this release include: Synaptic
Transmission (Activation of Kainate receptors upon glutamate
binding), Signaling by insulin receptor (Energy dependent regulation
of mTOR by LKB1-AMPK), DNA repair (Fanconi Anemia Pathway), Toll
Receptor Cascades (Toll Like Receptor 3(TLR3) cascade), Olfactory
Signaling Pathway, Cell Cycle Pathways, metabolic pathways for Amino
Acids, Carbohydrates, and Nucleotides, and the TCA cycle.</p>
<p><span lang="ru-RU"><b>About Reactome</b></span> 
</p>
<p lang="ru-RU">Reactome is a curated knowledgebase developed and
maintained by the Reactome Knowledgebase team (Lincoln Stein's group
at OICR/CSHL, Ewan Birney's group at the European Bioinformatics
Institute, and Peter D'Eustachio's group at NYU). Reactome covers
human biological processes ranging from basic pathways of metabolism
to complex events such as hormonal signaling and apoptosis. The
information in Reactome is provided by expert bench biologists, and
edited and managed as a relational database by the Reactome staff.
New material is peer-reviewed and revised as necessary before
publication to the web. Reactome entries are linked to corresponding
ones in NCBI, Entrez Gene, RefSeq, OMIM, Ensembl genome annotations,
HapMap, UCSC Genome Browser, KEGG, ChEBI and Gene Ontology (GO).The
web interface allows users to view the curated annotations of human
biological processes and orthology-based electronic inferences from
these annotations for 22 other species. 
</p>
<p><span lang="ru-RU">Updated release statistics and the Editorial
Calendar are available. Data download including database dumps and
protein-protein interaction datasets are available from the download
page on the website. Reactome data can be exported in SMBL, PSI
MITAB, Protégé, and BioPAX Level 3 (Release 1.0) and Level 2
format. Like everything in Reactome, these downloaded and exported
materials can be reused. Users can subscribe to Reactome announcement
list from the webpage
</span><font color="#000080"><span lang="zxx"><u><a href="http://mail.reactome.org/mailman/listinfo/reactome-announce" target="_blank">http://mail.reactome.org/mailman/listinfo/reactome-announce</a></u></span></font><span lang="ru-RU">.
</span>
</p>
<p style="margin-bottom: 0.5cm;"><a name="12593a8a6c28dff1_12593a647e731975_125939"></a>
<span lang="ru-RU">Reactome is seeking expert help for the curation
of new modules. The Reactome knowledgebase relies on collaborations
with research biologists to construct expert consensus views of key
biological processes, and to integrate these with other processes
already in Reactome. We are seeking new author-collaborators. If
you're interested, or would like more information about our data
acquisition process, please contact us at </span><font color="#000080"><span lang="zxx"><u><a href="mailto:editorial@reactome.org" target="_blank">editorial@reactome.org</a></u></span></font><span lang="ru-RU">.
For questions and comments please reply to this message or write to
</span><font color="#000080"><span lang="zxx"><u><a href="mailto:help@reactome.org" target="_blank">help@reactome.org</a></u></span></font><span lang="ru-RU">.
</span>
</p>
<p><span lang="ru-RU"><b>Other Reactome projects</b></span> 
</p>
<p><span lang="ru-RU">A preliminary list of projects now underway to
extend Reactome pathway curation spin-offs specific to non-human
model organisms with contact information is available from
</span><font color="#000080"><span lang="zxx"><u><a href="http://www.reactome.org/other_reactomes.html" target="_blank">http://www.reactome.org/other_reactomes.html</a></u></span></font><span lang="ru-RU">.
Users interested in contributing to these endeavors or expanding them
scope of pathway annotations in the Reactome model to more organisms
can write to </span><font color="#000080"><span lang="zxx"><u><a href="mailto:help@reactome.org" target="_blank">help@reactome.org</a></u></span></font><span lang="ru-RU">.
</span>
</p>
<p lang="ru-RU"><b>Reactome Outreach </b>
</p>
<p><span lang="ru-RU">Reactome Outreach takes on a variety of forms,
such as public talks, lectures, visiting schools and colleges and
supporting science events. Education is a major focus of Reactome's
community outreach and aims to inform biologists, clinicians, and
bioinformaticians about what Reactome can do. Reactome training
teaches new and current users how to use Reactome resources to help
meet the efforts of their organizations, groups, or specific
audiences. Training and outreach is managed by Robin Haw; please
contact him at </span><font color="#000080"><span lang="zxx"><u><a href="mailto:outreach@reactome.org" target="_blank">outreach@reactome.org</a></u></span></font><span lang="ru-RU">
if you have an outreach request. </span>
</p>
<p lang="ru-RU"><br>The development of Reactome is supported by a
grant from the US National Institutes of Health (P41 HG003751), EU
grant LSHG-CT-2005-518254 "ENFIN", and the EBI Industry
Programme. 
</p>
<p style="margin-bottom: 0cm;"><br>
</p>