<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META content="text/html; charset=iso-8859-1" http-equiv=Content-Type>
<META name=GENERATOR content="MSHTML 8.00.6001.18904">
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT size=2 face=Calibri>Dear GO friends,</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Calibri></FONT> </DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Calibri>I'm doing a linguistic analysis of biological 
process terms in GO and, as a non-biologist, have encountered a puzzle in some 
terms related to pigmentation.</FONT></DIV>
<DIV>
<P style="LINE-HEIGHT: normal; MARGIN: 0in 0in 0pt 1in" class=MsoNormal><FONT 
face=Calibri><FONT size=2><SPAN style="mso-no-proof: yes"><IMG 
alt="is_a relationship" src="" width=15 height=15 
v:shapes="Picture_x0020_4"></SPAN><SPAN 
style="mso-spacerun: yes"> </SPAN><U>GO:0043473 :</U> <U>pigmentation:</U> 
The deposition or aggregation of coloring matter in an organism, tissue or cell 
</FONT></FONT></P>
<P style="LINE-HEIGHT: normal; MARGIN: 0in 0in 0pt 1.5in" class=MsoNormal><SPAN 
style="mso-no-proof: yes"><FONT face=Calibri><FONT size=2><IMG 
alt="is_a relationship" src="" width=15 height=15 
v:shapes="Picture_x0020_8"><SPAN 
style="mso-spacerun: yes"> </SPAN></FONT></FONT></SPAN><A 
title="View details of developmental pigmentation" href=""><FONT color=#0000ff 
size=2 face=Calibri>GO:0048066 : developmental pigmentation</FONT></A><FONT 
size=2 face=Calibri>: The developmental process that results in the deposition 
of coloring matter in an organism, tissue or cell. </FONT><A 
title="View gene products associated with this term" href=""></A><FONT 
face=Calibri><FONT size=2><SPAN style="mso-spacerun: yes"> </SPAN><SPAN 
style="mso-spacerun: yes"> </SPAN></FONT></FONT></P><SPAN 
style="mso-spacerun: yes">
<P style="LINE-HEIGHT: normal; MARGIN: 0in 0in 0pt 1.5in" class=MsoNormal><FONT 
face=Calibri><FONT size=2><SPAN style="mso-no-proof: yes"><IMG 
alt="is_a relationship" src="" width=15 height=15 
v:shapes="Picture_x0020_12"><SPAN 
style="mso-spacerun: yes"> </SPAN></SPAN><U><A 
title="View details of pigment accumulation" href=""><FONT 
color=#0000ff>GO:0043476 : pigment accumulation</FONT></A></U>: The aggregation 
of coloring matter in a particular location in an organism, tissue or cell, 
occurring in response to some external stimulus. </FONT></FONT><A 
title="View gene products associated with this term" href=""></A><FONT 
face=Calibri><FONT size=2><SPAN style="mso-spacerun: yes"> </SPAN><SPAN 
style="mso-spacerun: yes"> </SPAN></FONT></FONT></P></SPAN></DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Calibri></FONT> </DIV>
<DIV><FONT size=2><SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-GB; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA" 
lang=EN-GB>Pigment accumulation, a process that is in response to some external 
stimulus, is differentiated from developmental pigmentation, driven presumably 
by internal cues. These processes, however, are further differentiated by 
</SPAN><SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-US; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA">coloring 
matter being aggregated in the first and deposited, not aggregated, in the 
second. <SPAN style="mso-spacerun: yes"> Depositing and aggregating 
coloring matter differ in their verbal aspect--this is what interests me 
here.</SPAN></SPAN></FONT></DIV>
<DIV><SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-US; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA"><SPAN 
style="mso-spacerun: yes"><FONT size=2 
face=Calibri></FONT></SPAN></SPAN> </DIV>
<DIV><SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-US; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA"><SPAN 
style="mso-spacerun: yes"><FONT size=2>So my question is: Is it really not 
possible for <SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-GB; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA" 
lang=EN-GB>pigment aggregation to play any role in developmental pigmentation or 
for pigment deposition to play any role in response to external stimuli? Is this 
distinction intended?</SPAN></FONT></SPAN></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-US; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA"><SPAN 
style="mso-spacerun: yes"><SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-GB; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA" 
lang=EN-GB><FONT size=2 face=Calibri></FONT></SPAN></SPAN></SPAN> </DIV>
<DIV><SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-US; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA"><SPAN 
style="mso-spacerun: yes"><SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-GB; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA" 
lang=EN-GB><FONT size=2>The subtype processes under developmental pigmentation 
(cuticle, eye, and sex-specific pigmentation) give no clue and have their own 
aspectual problems.</FONT></SPAN></SPAN></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-US; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA"><SPAN 
style="mso-spacerun: yes"><SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-GB; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA" 
lang=EN-GB><FONT size=2 face=Calibri></FONT></SPAN></SPAN></SPAN> </DIV>
<DIV><SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-US; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA"><SPAN 
style="mso-spacerun: yes"><SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-GB; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA" 
lang=EN-GB><FONT size=2>I'd appreciate any 
thoughts.</FONT></SPAN></SPAN></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-US; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA"><SPAN 
style="mso-spacerun: yes"><SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-GB; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA" 
lang=EN-GB><FONT size=2 face=Calibri></FONT></SPAN></SPAN></SPAN> </DIV>
<DIV><SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-US; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA"><SPAN 
style="mso-spacerun: yes"><SPAN 
style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 11pt; mso-ascii-theme-font: minor-latin; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-fareast-theme-font: minor-latin; mso-hansi-theme-font: minor-latin; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-bidi-theme-font: minor-bidi; mso-ansi-language: EN-GB; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA" 
lang=EN-GB><FONT size=2>Colleen</FONT></SPAN></SPAN></SPAN></DIV></BODY></HTML>