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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">Dear all,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">The proposal has been made to obsolete all terms specifying the compound "methotrexate:<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">- GO:0051870 - methotrexate binding (F)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">- GO:0015350 - methotrexate transmembrane transporter activity (F)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">- GO:0051958 - methotrexate transport (P)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">- GO:0031427 - response to methotrexate (P)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">The reason for obsoletion is that methotrexate is a synthetic compound that is an analog of folic acid. It's effects on organisms are usually due to its similarity to folic acid, not due to any organism being
 evolved to deal with methotrexate specifically.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">There are 39 experimental, IC, or ISS annotations to this term by these groups:
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">- ARUK-UCL         6<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">- BHF-UCL            8<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">- CAFA                   1<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">- GeneDB             1<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">- RGD                     13<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">- UniProt              10<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">There are 0 InterPro2GO mappings to these terms.
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">These terms are not included in any subsets.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">Detailed suggestions for reannotation are present in the annotation review spreadsheet:<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><a href="https://docs.google.com/spreadsheets/d/1jnr6pFzq9r5UADhZyZOM-1DCRQ-7ziQ3bdfGE--r4lo/edit#gid=0">https://docs.google.com/spreadsheets/d/1jnr6pFzq9r5UADhZyZOM-1DCRQ-7ziQ3bdfGE--r4lo/edit#gid=0</a>
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">Any comments can be  added to the issue:
<a href="https://github.com/geneontology/go-ontology/issues/21998">https://github.com/geneontology/go-ontology/issues/21998</a>
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">We are opening a comment period for this proposed obsoletion. We’d like to proceed and obsolete this term on September 28th, 2021. Unless objections are received by 9/27/21, we will assume that you agree to
 this change.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">Thanks,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">-Karen<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p> </o:p></span></p>
</div>
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