Hi Katrien,<br><br>I've attached an Excel file of the goslim list with the following columns:<br><br>1. term name<br>2. GO id<br>3. aspect (biological process, cellular component, or molecular function)<br><br>Best wishes,<br>

<br>Tanya<br><br><br><br clear="all">Tanya Berardini<br>TAIR Curator<br><a href="http://www.arabidopsis.org" target="_blank">www.arabidopsis.org</a><br>
<br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jun 20, 2012 at 4:48 AM, Katrien Vandepitte <span dir="ltr"><<a href="mailto:Katrien.Vandepitte@bio.kuleuven.be" target="_blank">Katrien.Vandepitte@bio.kuleuven.be</a>></span> wrote:<br>


<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">





<div link="blue" vlink="purple" lang="NL">
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d" lang="EN-US">Hi Tanya,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d" lang="EN-US">Thank for the quick reply. I`m not familiar with an obo format  so if you could send me a simple list in any other format that would be great.
<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d" lang="EN-US"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d" lang="EN-US">Kind Regards,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d" lang="EN-US">Katrien<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d" lang="EN-US"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d" lang="EN-US"><u></u> <u></u></span></p>
<div style="border:none;border-top:solid #b5c4df 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"" lang="EN-US">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"" lang="EN-US"> <a href="mailto:tberardi@arabidopsis.org" target="_blank">tberardi@arabidopsis.org</a> [mailto:<a href="mailto:tberardi@arabidopsis.org" target="_blank">tberardi@arabidopsis.org</a>]
<b>On Behalf Of </b>Tanya Berardini<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, June 20, 2012 1:03 AM<br>
<b>To:</b> Susan Tweedie<br>
<b>Cc:</b> Katrien Vandepitte; <a href="mailto:gohelp@geneontology.org" target="_blank">gohelp@geneontology.org</a><br>
<b>Subject:</b> Re: Plant GO Slim categories<u></u><u></u></span></p>
</div><div><div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt">Hi Katrien,<br>
<br>
The file in the URL that Susan sent you should contain all the information that you need.  It can also be condensed to be just a simple list of terms.   Please let us know if you need help in doing that or if you require some other format.<br>



<br>
Best wishes,<br>
<br>
<br clear="all">
Tanya Berardini<br>
TAIR Curator<br>
<a href="http://www.arabidopsis.org" target="_blank">www.arabidopsis.org</a><br>
<br>
<u></u><u></u></p>
<div>
<p class="MsoNormal">On Tue, Jun 19, 2012 at 4:53 AM, Susan Tweedie <<a href="mailto:sart2@gen.cam.ac.uk" target="_blank">sart2@gen.cam.ac.uk</a>> wrote:<u></u><u></u></p>
<div>
<p class="MsoNormal">Dear Katrien<u></u><u></u></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Thank you for contacting the GO Consortium with your question. <u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">The GO consortium Plant GO slim can be downloaded from our website:<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><a href="http://www.geneontology.org/GO_slims/goslim_plant.obo" target="_blank">http://www.geneontology.org/GO_slims/goslim_plant.obo</a><u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">This file is in obo format which contains full term details for each term entry but could be used to generate a simple list. I am cc'ing Tanya Beradini from TAIR in case she is aware of other formats of this information.<u></u><u></u></p>



</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Please get back to us if you have further questions.<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Best wishes,<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Susan Tweedie<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">FlyBase GO curator<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">On 19 Jun 2012, at 19/Jun/2012 10:04:43, <a href="mailto:go-helpdesk-bounces@lists.stanford.edu" target="_blank">
go-helpdesk-bounces@lists.stanford.edu</a> wrote:<u></u><u></u></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><br>
<br>
<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><b>From: </b><span style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif""><a href="mailto:katrien.vandepitte@bio.kuleuven.be" target="_blank">katrien.vandepitte@bio.kuleuven.be</a></span><u></u><u></u></p>



</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><b>Date: </b><span style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">18 June 2012 20:41:12 BST</span><u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><b>To: </b><span style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif""><a href="mailto:go-helpdesk@mailman.stanford.edu" target="_blank">go-helpdesk@mailman.stanford.edu</a></span><u></u><u></u></p>



</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><b>Subject: </b><b><span style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif"">GO Help query (from website)</span></b><u></u><u></u></p>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt"><br>
<br>
<br>
Email: <a href="mailto:katrien.vandepitte@bio.kuleuven.be" target="_blank">katrien.vandepitte@bio.kuleuven.be</a><br>
Name: Ontology (from Vandepitte)<br>
Text: Dear,<br>
Where can I find a list of all possible Plant GO Slim categories?<br>
Kind Regards<br>
<br>
<u></u><u></u></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div></div></div>
</div>

</blockquote></div><br>