<HTML>
<HEAD>
<TITLE>NCBO Seminar Series - Meeting Info for Wed, Sept 2!</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<FONT FACE="Calibri, Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:11pt'>Hello All! <BR>
 <BR>
The next NCBO Seminar Series will be held <FONT COLOR="#7D0000">Wednesday, Sept 2, at 10am PST.</FONT><FONT COLOR="#7B0000"> </FONT>The seminar<FONT COLOR="#7B0000"> </FONT>will be presented by <FONT COLOR="#7D0000">Dr. Raimond Winslow and Stephen Granite of the Institute for Computational Medicine</FONT><FONT COLOR="#7E0000">. </FONT>The title of the talk will be <B>“Progress Report: Ontology-based annotation of biomedical time–series data.”<BR>
</B><BR>
Below is Information on how to join this week’s online meeting and accompanying teleconference. <BR>
<BR>
Please contact me with any questions at <FONT COLOR="#0000FF"><U><a href="skanel@stanford.edu">skanel@stanford.edu</a></U></FONT>. For a schedule of 2009 presentations through September, or for more information about the series, please visit the Seminar Series home page: <FONT COLOR="#0000FF"><U><a href="http://www.bioontology.org/seminar-series">http://www.bioontology.org/seminar-series</a></U></FONT>.<BR>
<FONT COLOR="#7C0000"><BR>
</FONT>We hope to see you there.<BR>
<BR>
<BR>
<FONT COLOR="#0000FF"><U>Title</U>: Progress Report: Ontology-based annotation of biomedical time–series data<BR>
<BR>
<U>Abstract:</U> In a collaborating project with the NCBO, we are developing an ontology for describing the most common form of cardiovascular data – the electrocardiogram (ECG). The ontology includes the concepts needed to describe data collection protocols (number of leads, lead placement, instrumentation), the ECG waveform and its features in health and disease (e.g., QRS, T waves etc; abnormalities of the ECG such as elevated ST segment, inverted T wave, etc), data computed from the ECG (e.g., QT interval variability, QRS width, etc), algorithms used to compute these data, and interpretations (Minnesota codes). It has been deposited at the NCBO (Electrocardiography Ontology, ID 1146). We will review this ontology.<BR>
<BR>
We are developing this ontology so that clinical researchers can manage, analyze, and share semantically labeled ECG data on the CardioVascular Research Grid (CVRG). We will give a demonstration of several components of this data management and analysis workflow. These components have been developed using the Google Web Toolkit, with data visualization supported by the Google Visualization API. The demonstration will include: a) a review of the CVRG Dashboard; b) selection and upload of ECG time-series data; c) data analysis; and d) visualization and annotation of the ECG waveform. The latter is done by invoking Bioportal REST services from the web-interface to retrieve concepts and definitions from the ontology. This represents substantial progress in our effort to develop the “electronic ECG chart recorder”.<BR>
</FONT><FONT COLOR="#0000FB"><BR>
</FONT></SPAN></FONT><SPAN STYLE='font-size:11pt'><FONT FACE="Tahoma, Verdana, Helvetica, Arial"><BR>
 <BR>
 Topic: NCBO Seminar Series <BR>
 Date: The 1st & 3rd Wednesday of every 1 months<BR>
 Time: 9:45 am, Pacific Daylight Time (San Francisco, GMT-07:00) <BR>
<B> Meeting Number: 926 719 478 <BR>
 Meeting Password: ncbomeeting <BR>
</B><BR>
 <BR>
 ------------------------------------------------------- <BR>
 To join the online meeting (Now from iPhones too!) <BR>
 ------------------------------------------------------- <BR>
 1. Go to <FONT COLOR="#0000FF"><U><a href="https://stanford.webex.com/stanford/j.php?ED=107799137&UID=0&PW=NNzlkODFlYWVm&RT=MiM0">https://stanford.webex.com/stanford/j.php?ED=107799137&UID=0&PW=NNzlkODFlYWVm&RT=MiM0</a></U></FONT> <BR>
 2. Enter your name and email address. <BR>
 3. Enter the meeting password: ncbomeeting <BR>
 4. Click "Join Now". <BR>
 5. Follow the instructions that appear on your screen. <BR>
 <BR>
 To view in other time zones or languages, please click the link: <BR>
 <FONT COLOR="#0000FF"><U><a href="https://stanford.webex.com/stanford/j.php?ED=107799137&UID=0&PW=NNzlkODFlYWVm&ORT=MiM0">https://stanford.webex.com/stanford/j.php?ED=107799137&UID=0&PW=NNzlkODFlYWVm&ORT=MiM0</a></U></FONT> <BR>
 <BR>
 ------------------------------------------------------- <BR>
 To join the audio conference <BR>
 ------------------------------------------------------- <BR>
 Call-in toll number (US/Canada): 1-650-429-3300 <BR>
 Global call-in numbers: <FONT COLOR="#0000FF"><U><a href="https://stanford.webex.com/stanford/globalcallin.php?serviceType=MC&ED=107799137&tollFree=0">https://stanford.webex.com/stanford/globalcallin.php?serviceType=MC&ED=107799137&tollFree=0</a></U></FONT> <BR>
 <BR>
 Access code:926 719 478 <BR>
 <BR>
 ------------------------------------------------------- <BR>
 For assistance <BR>
 ------------------------------------------------------- <BR>
 1. Go to <FONT COLOR="#0000FF"><U><a href="https://stanford.webex.com/stanford/mc">https://stanford.webex.com/stanford/mc</a></U></FONT> <BR>
 2. On the left navigation bar, click "Support". <BR>
 <BR>
 You can contact me at: <BR>
  <FONT COLOR="#0000FF"><U><a href="skanel@stanford.edu">skanel@stanford.edu</a></U></FONT> <BR>
 1-650-736-0786 <BR>
 <BR>
 To update this meeting to your calendar program (for example Microsoft Outlook), click this link: <BR>
 <FONT COLOR="#0000FF"><U><a href="https://stanford.webex.com/stanford/j.php?ED=107799137&UID=0&ICS=UMI&LD=1&RD=2&ST=1&SHA2=sscJxPSrxubkyAnBruXELuZe4XBKeHnhQa70aJiFfUI=&RT=MiM0">https://stanford.webex.com/stanford/j.php?ED=107799137&UID=0&ICS=UMI&LD=1&RD=2&ST=1&SHA2=sscJxPSrxubkyAnBruXELuZe4XBKeHnhQa70aJiFfUI=&RT=MiM0</a></U></FONT> <BR>
 <BR>
 <BR>
 WebEx will automatically setup Meeting Manager for Windows the first time you join a meeting. To save time, you can setup prior to the meeting by clicking this link: <BR>
 <FONT COLOR="#0000FF"><U><a href="https://stanford.webex.com/stanford/meetingcenter/mcsetup.php">https://stanford.webex.com/stanford/meetingcenter/mcsetup.php</a></U></FONT> <BR>
 <BR>
 <BR>
 IMPORTANT NOTICE: This WebEx service includes a feature that allows audio and any documents and other materials exchanged or viewed during the session to be recorded. By joining this session, you automatically consent to such recordings. If you do not consent to the recording, do not join the session. <BR>
 <BR>
 <BR>
</FONT><FONT FACE="Arial"><BR>
</FONT><FONT FACE="Calibri, Verdana, Helvetica, Arial">--- <BR>
Shauna B. Kanel<BR>
Communications Coordinator & Web Editor<BR>
Stanford University<BR>
Division of Biomedical Informatics Research (BMIR)<BR>
National Center for Biomedical Ontology (NCBO)<BR>
<BR>
Medical School Office Building, Room X-217<BR>
251 Campus Drive | Stanford, CA 94305-5101<BR>
(650) 736-0786<BR>
<FONT COLOR="#0000FF"><U><a href="skanel@stanford.edu">skanel@stanford.edu</a></U></FONT></FONT></SPAN>
</BODY>
</HTML>